중등부의 목동종로엠학원은 고등부의 목동종로학원과 다른 법인에서 운영하는 학원이다. 하지만 광고지 등에서는 '목동종로엠학원'이 아닌 '목동종로학원'이라 표기하는 경우가 종종 있으며, 이는 두 학원 간의 관계에 대해 오해를 불러올 소지를 낳는 원인이 되고 있다. 또한 위 광고지는 김포외고 입시부정사태가 명확해진 후 조간신문을 통해 발송된 광고지로, 사건 이후에 이러한 광고지를 보내어 논란을 낳았다. ⓒ이준혁 2007.12.07